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方静平副教授

时间:2021-01-21浏览:22

  方静平博士,副教授

E-mail:jinphia@fjnu.edu.cn

QQ:694645535

通讯地址:福建省福州市福建师范大学旗山校区理工楼13号楼 (350117)

硕士招生方向:生物化学与分子生物学

研究方向:

海洋微藻、番木瓜、甘蔗等物种比较基因组学与功能基因组学研究

利用测序新技术辅助和改善基因组组装

功能性基因组结构变异鉴定

开发分子遗传标记辅助经济作物育种

 

一、学习与工作经历:

2017.8至今    福建师范大学亚博yabo888vip网页登录

2017.1-2017.6  福建农林大学基因组与生物技术研究中心 助理研究员

2013.7-2014.8  美国伊利诺伊大学香槟校区Ray Ming实验室 联合培养博士生

2010.9-2016.12 福建农林大学作物科学学院 农学博士(保研、硕博连读)导师:Ray Ming/陈如凯

 

二、主持或参与的主要科研课题:

主持项目:

(1) 球等鞭金藻(Isochrysis galbana)岩藻黄素合成途径关键基因挖掘及其对光质的响应机制研究,41906096,国家自然科学基金青年基金,27万元,2020/01-2022/12,主持,在研;

(2) 甘蔗割手密(S. spontaneum)全基因组微卫星标记的开发和多态性鉴定,2019J0102,福建省自然科学基金项目(青年创新项目),4万元,2019/04-2022/04,主持,在研;

(3) 2018年福建省级科技特派员工作经费,校内编号:K2-1030,2万元,主持

(4) 2019年福建省级科技特派员工作经费,校内编号:K2-1125,2万元,主持

(5) 2019年福州市科技特派员工作经费(闽榕茶叶有限公司),校内编号:SC-194,2万元,主持

(6) 2020年福州市科技特派员工作经费,项目编号:暂无,2万元,主持

(7) 不同光质下球等鞭金藻(Isochrysis galbana)岩藻黄素生物合成的表达谱研究,JT180082,福建省教育厅项目(A类),1万元,2018/10-2021/9,主持,在研;

(8) 甘蔗高贵种“中果”串联复制基因的基因组学特征研究,广西甘蔗生物学重点实验室开放课题,10万元,2020/07-2022/06,主持,在研;

(9) 福建师范大学亚博yabo888vip网页登录2018年“溪源江学者”扶持计划项目(科研骨干扶持项目),FZSKG2018004,3万元,2018/11-2019/11,主持,已结题;

(10) 福建师范大学人才引进科研启动项目,Z0210509,3万元,主持

 

参与项目: 

(11) 蔗汁与糖蜜综合利用,CARS-170501,部委其他项目,280万元,2017/01-2020/12,排名第2,在研;

(12) 不规则互作图可靠性及其在蛋白质相互作用网络中的应用,61702100,国家自然科学基金,25万元,2018/01-2020/12,排名第2,在研;

(13) 野生和栽培菠萝基因组结构变异的比较及其对重要农艺性状的影响,31701874,国家自然科学基金,25万元,2018/01-2020/12,排名第3,在研;

(14) 番木瓜cpMYB24基因调控雄蕊发育的研究,2018J01601,福建省自然科学基金高校联合资助面上项目,10万元,2018/05-2021/04,排名第2,在研;

(15) 文昌鱼性腺发育的分子机制,2019J01277,福建省自然科学基金高校联合资助面上项目,10万元,2019/04-2022/04,排名第4,在研;

(16) 文昌鱼哈氏窝调控性腺周年变化的分子机制,JT180104,福建省教育厅项目,1万元,2018/10-2021/10,排名第4,在研;

(17) 几种贝类开发保健食品原料和精深加工技术研究,校内编号:DH-1388,财务编号:HCH01388,企事业单位委托科技项目,10万元,2018/05-2021/04,排名第4,在研;

(18) 虾蟹类加工副产物生产壳寡糖技术及产品开发,校内编号:DH-1387,财务编号:HCH01387,企事业单位委托科技项目,20万元,2018/04-2021/03,排名第5,在研;

 

三、参与的主要教改课题:

细胞生物学,2020年福建省一流本科课程,参与

 

四、发表期刊论文

(1) Fang J.#*, Lin A.#, Yuan X.#, et.al. The complete chloroplast genome of Isochrysis galbana and comparison with related haptophyte species [J]. Algal Research, 2020, 50:101989. doi: 10.1016/j.algal.2020.101989.

(2) Fang J., Wood A., Chen Y., Yue J., Ming R*. Genomic variation between PRSV resistant transgenic SunUp and its progenitor cultivar Sunset [J]. BMC genomics, 2020, 21:398. doi: 10.1186/s12864-020-06804-7.

(3) Fang J., Lin A., Qiu W., Cai H., Umar M., Chen R. and Ming R*. Transcriptome profiling revealed stress-induced and disease resistance genes up-regulated in PRSV resistant transgenic papaya. Frontiers in Plant Science, 2016, 7:855. doi: 10.3389/fpls.2016.00855.

(4) Fang J., Miao C., Chen R., Ming R*. Genome-wide comparative analysis of microsatellites in pineapple [J]. Tropical Plant Biology, 2016, 9(3):117-135.

(5) Fang J., Wood A., Chen R., Ming R*. Molecular basis of off-type microsatellite markers in papaya [J]. Euphytica, 2016, 209(2):323-339.

(6) 方静平, 林艺华, 杨川毓等. 抗环斑病毒番木瓜的开发技术及转基因对基因组影响研究进展[J]. 福建农林大学学报(自然科学版), 2016, 45(2): 121-128. (核心期刊收录)

(7) 方静平, 阙友雄, 陈如凯*. 甘蔗属起源及其与近缘属进化关系研究进展[J]. 热带作物学报, 2014, 35(4): 816-822. (核心期刊收录)

(8) 方静平, 苏亚春, 游倩等. 甘蔗β-1,3-葡聚糖酶基因的电子克隆与分析[J]. 生物信息学, 2012, 10(3): 199-207. (核心期刊收录)

(9) Miao C., Fang J., Li D., Liang P., Zhang X., Yang J., Schnable J., Tang H*. Genotype-Corrector: improved genotype calls for genetic mapping in F2 and RIL populations [J]. Scientific Reports, 2018, 8:10088. doi:10.1038/s41598-018-28294-0.

(10) Chen D., Zhang Q., Tang W., …, Fang J., et al. The evolutionary origin and domestication history of goldfish (Carassius auratus) [J]. PNAS, 2020, 117(47): 29775-29785.

(11) Zhang J., Zhang X., Tang H., …, Fang J., et al. Allele-defined genome of the autopolyploid sugarcane Saccharum spontaneum L. [J]. Nature Genetics, 2018, 50: 1565–1573.

(12) Liu K., Yuan X., Liang L., Fang J. et.al. Using CRISPR/Cas9 for multiplex genome engineering to optimize the ethanol metabolic pathway in Saccharomyces cerevisiae [J]. Biochemical Engineering Journal, 2019, 145:120-126.

(13) Xue T., Liu K., Chen. D., Yuan X., Fang J., et al.Improved bioethanol production using CRISPR/Cas9 to disrupt the ADH2 gene in Saccharomyces cerevisiae [J]. World Journal of Microbiology and Biotechnology, 2018, 34(10): 154-160. 

(14) Xue T., Chen D., Su Q., Yuan X., Liu K., Huang L., Fang J., et al. Improved ethanol tolerance and production of Saccharomyces cerevisiae by global transcription machinery engineering via directed evolution of the SPT8 gene [J]. Food Biotechnology, 2019, 33(2): 155-173.

(15) Xue T., Sun M., Chen D., Yuan X., Liu K., Chen J., Ye H., Fang J., et al. Molecular Cloning and Overexpression of the Transglutaminase Gene from Streptomyces mobaraensis [J]. Food Science and Technology Research, 2019, 25(5): 687-694.

(16) Yang C., Powell C., Duan Y., Shatters R., Fang J., Zhang M.*. Deciphering the bacterial microbiome in huanglongbing-affected citrus treated with thermotherapy and sulfonamide antibiotics [J]. PloS one, 2016, 11(5): e0155472. doi: 10.1371/journal.pone.0155472.

(17) Ming R.*, VanBuren R., Wai C., et al. The pineapple genome and the evolution of CAM photosynthesis [J]. Nature Genetics, 2015, 47(12): 1435-1442.

(18) Guo J., Xu L., Fang J., Su Y., Fu H., Que Y., Xu J. A novel dirigent protein gene with highly stem-specific expression from sugarcane, response to drought, salt and oxidative stresses [J]. Plant Cell Rep, 2012, 31: 1801-1812.

(19) 陈兰平, 陈由强, 方静平等. 甘蔗SPS基因家族成员表达与糖分积累关系解析[J]. 热带作物学报, 2014, 35(7): 1354-1361.

(20) 张积森, 林清凡, 方静平等. 甘蔗SPSⅢ启动子区ATCT-motif和CAT-box元件的酵母单杂交报告载体构建[J]. 福建师范大学学报, 2013, 29(1) : 86-89, 100.

(21) 张积森, 郑月霞, 方静平等. 甘蔗SPSⅢ基因启动子5’侧翼缺失的GUS表达载体构建[J]. 福建教育学院学报, 2012, (3): 118-121.

(22) 陈平华, 方静平, 许莉萍等. 球磨机高通量提取甘蔗叶片DNA研究[J]. 热带农业科学, 2010, 30(10): 8-12.